上海市（复旦大学附属）公共卫生临床中心（简称“公卫中心”）是复旦大学附属三级甲等医院、又名复旦大学附属中山医院南院；全国传染病医师进修教育培训基地、中国疾病预防控制中心艾滋病临床进修教育基地、上海市疾病控制中心临床基地；为复旦大学传染病学国家教育部重点学科组成部分、复旦大学妇产科学国家教育部重点学科组成部分、国家临床重点专科（传染病学）建设学组、上海市传染病重点学科建设单位之一；国家级药物临床试验机构资格认定单位；上海市危重孕产妇会诊抢救中心、上海市产科肝病监护中心、上海市艾滋病诊疗中心、上海市新发与再现传染病研究所、国家中医药管理局中医药防治传染病重点研究室（临床基地）建设单位。连续四届蝉联上海市文明单位。公卫中心本部地处上海市金山区，紧邻S4、G15高速公路亭卫公路出口处，占地33.3公顷，总建筑面积101389.22平方米；分部位于上海市虹口区，占地45亩，建筑面积2.6万平方米。是上海市人民政府投资建成的集临床医疗、教学、科研及应对突发公共卫生事件于一体的重大工程，为2004年市政府一号工程，是上海市加强公共卫生体系建设第一轮三年行动计划的重要组成部分。于2004年11月16日落成启用。