南京市胸科医院建于1950年，是江苏省规模最大的胸部专科医院，承担着省、市胸部疾病的医疗、教学、科研任务。是"东南大学医学院教学医院"、"南京市结核病研究所"、"南京肺灌洗中心"、。2003年与澳大利亚阿尔弗雷德医院建立友好医院及科研技术合作伙伴关系，2004年成功地为两例终末期慢性阻塞性肺病患者实施了单肺移植、对侧肺减容术，填补了南京地区人体肺移植技术的空白。2005年加入鼓医集团后,与鼓楼医院胸心外科联合成立了"鼓医集团心血管病中心"。医院在胸部疾病的诊断、治疗等方面，具有较高的专科水平而享誉省内外。目前医院拥有编制床位500张，现职人员663人，有中高级职称的专业技术人员250人，设有胸心外科、呼吸内科、结核病科、心血管内科、麻醉科、重症医学科、放疗科、中西医结合科、急救中心等12个临床科室，其中胸外科、呼吸内科、结核病科、心血管内科为南京市重点专科；设有医学影像科、检验科、病理科、心导管室、气管镜室等10个医技科室；另有中心实验室、胸心外科研究室、胸部肿瘤研究室、肺结核病研究室等。