西安航天总医院建院于1965年，医院地处国防“三线”陕西凤县秦岭山区29年，在十分艰难困苦的工作和生活条件下，为保障航天科研生产任务的顺利开展，为保障科研人员和当地群众的身体健康，做出了重要贡献。1993年，随着国家对“三线”建设的总体调整，医院随航天六院（原航天067基地）走出大山，迁入西安市。建院近五十年来，历经国防“三线”山区和西安新址不同时期的努力奋斗，与祖国的航天事业同发展、共奋进，已成为一所集医疗、教学、科研、急救、预防、保健于一体的现代化综合医院。医院为陕西省、西安市、安康市、雁塔区、长安区、凤县、华县、甘肃省两当县等医保定点机构，为西安市、长安区、雁塔区、阎良区、蓝田县、周至县、宁陕县等新型农村合作医疗定点机构，为保障航天科研生产和人民群众身体健康发挥了重要作用。