广东三九脑科医院是国务院国资委全资建设的现代化大型脑专科医疗机构，由国务院国资委直属的“华润集团”子公司华润医疗集团管理。

华润医疗集团在2011年成立于香港，是华润集团的全资子公司。华润集团是国务院国资委直接管理的大型国有重点骨干企业之一，2016年位列世界500强第91位。华润医疗集团作为华润集团旗下专门从事医院投资及运营管理的机构，是华润集团未来重点打造的以医疗为核心的健康服务产业平台；致力于中国医疗卫生事业的长远健康发展，秉承华润医疗集团“与您携手、改变生活”的企业使命，依托华润集团雄厚的综合实力、多元化投资优势和先进的管理理念；以“变革中国医疗体系，创建世界医疗健康服务集团”的企业愿景，以“五年内成为中国规模领先、医术精湛、服务优质、管理精益的大型医疗健康服务集团”为目标。目前，华润医疗集团在医院投资、医院运营和医疗健康全产业链管理等领域做出了积极的探索和实践。

广东三九脑科医院是华润医疗集团旗下的“明星医院”，1994年经国家卫生部批准设立。实际展开床位800张。按广东省卫计委批复，医院规模和建设水平“相当于三级甲等医院”。国内著名神经内（外）科专家学者吴若秋、李龄、谭启富、许建平、唐刚揆、尹普安、王象昌、成良正、田新良等在不同的历史发展时期直接参与了医院临床医疗和科研工作。著名癫痫内科专家沈鼎烈教授及刘兴洲教授、神经内科专家田时雨教授、神经外科专家黄勤教授、中医专家欧阳群教授，作为医院首席专家常年领纲主持相关学科建设。原全国人大副委员长吴阶平、原国家卫生部部长陈敏章为医院题写了“勇攀医学科学高峰，不断提高诊治水平”、“发挥专科优势，争创一流技术”，对医院建设取得的成绩予以赞扬和勉励。

医院拥有国内先进、华南地区领先水平的癫痫诊疗中心（由癫痫内科、癫痫外科及电生理监测中心组成）；脑部肿瘤外科、放疗与化疗；脑血管病的内科、外科、介入；小儿神经系统疾病的内、外科治疗；以手术为特色的脑瘫综合康复治疗；系列难治性精神病的综合治疗和植物状态促醒等一批极具专业特色优势的学科群，强大的神经外科由肿瘤神经外科、颅底神经外科、小儿神经外科、综合神经外科、微侵袭神经外科、血管神经外科、癫痫神经外科等7个学科组成，广东省头痛诊疗中心、眩晕诊疗中心、脑血管病内科诊疗中心、神经系统感染和变性疾病诊疗中心、小儿神经内科、脑瘫诊疗中心、神经康复诊疗中心、心理行为疾病诊疗中心、睡眠医学诊疗中心、儿童神经肿瘤中心、神经电生理中心（含脑磁图等）等学科在国内和东南亚地区形成了重要的影响和知名度，受到国内外同行和患者的肯定。

牵头成立了广东省华南癫痫与脑科学研究所，拟从事脑疾病基础和临床研究。医院现为中国抗癫痫协会立体定向脑电图与脑定位学专业委员会、广东省心理学会临床心理专业委员会、广东省康复医学会重症康复分会等学会主委单位。

多年来，医院坚持“更专业、更有效、更经济”核心价值观，在广东省民情调查调研机构的患者满意度调查中，位列全省三甲专科医院第二名，省直属医疗机构“新农合”病人就诊量第三、农民自费比例最低，省行风评议先进单位。医院发自内心地用行动理解和尊重患者、主动承担国有企业社会责任的实践，受到了社会各界特别是患者的高度认同。