上海市第五人民医院创建于1904年，为工部局所建的“西人隔离医院”。1939年由日本同仁会接办，改称“同仁会医院”。1945年收归国有，定名为“上海市市立第五医院”，1949年上海解放，更名为“上海市市立第五人民医院”。1960年迁至闵行，一度又称“上海市闵行区中心医院”、“上海市工农医院”，1984年经批准恢复“上海市第五人民医院”院名。1995年原闵行区传染病医院并入。1998年闵行区人民政府和原上海医科大学联手共建市五医院，随着原上海医科大学与复旦大学合并为新的复旦大学，现医院又称“复旦大学附属上海市第五人民医院”，为二级甲等非营利性公立医院。医院目前占地5.81公顷（约90亩），建筑面积6万平方米。医院核定床位584张，开放床位800张，年门急诊量超过70万人次，年住院病人超过1.4万人次，住院病人手术超过6，000例次；现有职工1，000余人，专业技术人员900余人，其中高级职称百人，硕博士46人。医院现拥有上海市百人计划1名，上海市曙光学者1名，上海市医苑新星1名，上海市区县百人计划4名，闵行区卫生系统学科带头人14名；有6人享受国务院特殊津贴；4位专家列入上海领军人才“后备队”（闵行领军人才）培养计划。上海市第五人民医院作为复旦大学附属医院和蚌埠医学院、皖南医学院教学医院，医院每年承担五所院校临床、公卫等七个专业200余人的教学任务，拥有授课教授和兼职教授60余人。医院每年发表学术论文约200篇，约1/3在国内核心和权威期刊上发表，部分在国外期刊中发表，也有一些有IF、SEI、SCI指数的文章。