医院始建于1987年，医院原址位于老城区钟楼巷内，由于地理位置条件限制，2010年县政府决定对中医医院实施整体搬迁，于2013年9月24日整体搬迁至现在的位置。医院开设7个病区、13个一级科室、10个二级科室及6个职能科室，肝胆病、针灸科被列为市级重点专科专病，骨伤科被列为省级重点专科。现有职工281人，其中正式职工129人，专业技术人员占86%。有高级职称14名，中级职称43名，大专以上学历80名，医院现有甘肃省名中医1名，庆阳市名中医3名，有中医类别执业医师34名。