海西州蒙藏医院成立于一九七八年，是一所集蒙藏医药医疗、制剂、教学、科研为一体的全民所有制综合性民族医医院，也是我省唯一的二级甲等蒙藏医医院。担负着全州蒙藏医药学的继承、挖掘整理、研究开发和运用民族医药为广大群众健康服务的任务，医院占地面积1.9万平方米，建筑面积6350平方米，设置病床60张。设有药浴、肝胆、骨伤、蒙医五疗等特色专科及蒙藏医内、外、妇、儿、蒙藏西医结合科等临床科室，另设有B超、心电、检验、X光室和图书资料室、蒙藏药标本室等。医院技术力量较雄厚，现有正式职工48人，其中卫技人员38人，制剂生产技术人员8人。卫生技术人员有蒙医主任医师1人、副主任医师2人，中级职称14人，大专以上学历者占65%。医院骨伤专科于2002年被评为青海省省级特色专科，学科带头人巴图克主任医师荣获中华名医名药名老中医药专家委员会颁发的中华名医称号。医院自建院以来，始终坚持以突出民族医药特色、发挥蒙藏医药优势，运用传统医药理论并结合现代医学技术为立足点和出发点，诊治了大量门诊、住院患者，尤其在治疗胃肠、肝胆、风湿、骨伤、脑震荡、心脑血管疾病等方面诊疗方法独特、疗效显著、深受广大患者欢迎。医院努力为基层及周边地区培养蒙藏医药专业人才，先后培训的乡、村级蒙藏医药人才360余名，接收大中专院校学生和基层的蒙藏医药人员实习、培训、进修1420余人次；开展院内师带徒工作，狠抓医院职工的在职教育；加强了医院后备力量的培养工作，使民族医药事业后继有人。医院制剂室，经先后3次改造生产车间、添置设备、派人员外出进修学习，现已能够生产常用散、汤剂300余种，丸剂60余种，贵重药10余种其中名贵药七十味珍珠丸、仁青芒胶、坐志达协、二十五味松石丸等以其临床效果好、质优价廉，受到广大患者的欢迎。医院还为基层及周边地区蒙、藏医院及卫生院调剂部分蒙藏成药，发挥了蒙藏医药药品调剂中心的作用。  近年来，医院开展了蒙藏医古籍文献的挖掘、整理、研究工作，先后在各类刊物上发表学术论文60余篇，成立了蒙藏医药研究室开展蒙藏医药的研究开发工作。  医院始终坚持办院方向，以提高服务质量为核心，不断加强内涵建设，狠抓医德医风建设和职工思想政治工作，牢固树立质量意识、服务意识和竞争意识。医院按青海省蒙藏医院分级管理办法与标准创建达标，进一步走向科学化、规范化建设。