南涧彝族自治县中医医院成立于1995年元旦，占地面积4085平方米，现有业务用房3600平方米，位于南涧镇富民街126号。是一所融医疗、教学、科研、康复为一体的国家二级甲等综合中医医院，担负着全县的医疗救治、农村巡回医疗和基层卫生院中医业务技术指导等工作。云南省中医医疗集团医院、昆明卫生职业学院教学医院，城镇医保和新农合定点医院。

医院现有编制床位200张，实际开放病床100张，现有职工146人。其中：在编69人，非编77人。卫生专业技术人员124人，正高级职称1人，副高级职称6人，中级职称23人，执业医师29人，中医类别执业医师11人，药剂人员12人，医技人员14人，护理人员51人。医院下设党政办公室、医务科、护理部、财务科、设备科等管理科室和内科、外科、针灸科、急诊科、老年病科5个临床科室，医学检验科、功能检查科、放射科、药剂科4个医技科室。