百色市第二人民医院始建于1978年，是我市唯一一所集精神医疗、科研及教学于一体的国家二级精神疾病专科医院，是全市精神卫生防治技术指导与培训机构，全市城镇职工医保、新型农村合作医疗、低保医疗救助定点医院。2014年3月，市编委会正式下文同意百色市精神卫生中心挂靠我院，实行两块牌子一套人员管理。医院定编病床150张，实际开放病床350张。核定人员编制数140人，现在职在编人员为118人，聘用人员119人，离退休人员67人。在职人员中卫生专业技术人员173人（副高以上职称15人，中级职称44人），管理人员5人，其他技术人员6人，后勤人员51人。

医院分为总院和城北综合门诊部两部分，总院位于东坪路长蛇岭巷29号，城北综合门诊部位于城北二路36号。总院主要为办公和开展精神专科疾病诊疗业务，设有党政办、医务科、护理部、人事科、财务科、感控科、质控科、精神卫生防治管理工作办公室、保卫科、总务科、信息科等11个职能科室，设有精神一科、精神二科、精神三科、精神四科等4个临床科室，设有检验科、医技科、药剂科3个辅助科室。城北综合门诊部主要开展颈腰腿痛、癫痫、心理障碍疏导与治疗等业务，设有内一科、内二科、心理科3个临床科室。