福建医科大学附属第二医院、第二临床医学院是泉州地区现代医学的发祥地，是我省主要的医疗、教学、科研基地之一，是福建省首批通过卫生部评审的四家三级甲等综合性医院之一，是博士、硕士研究生学位授权点单位。医院始建于1881年，为英国教会医院，原名“惠世医院”，解放后，改为晋江专区第二医院。1973年升格为福建医科大学附属第二医院。2000年成为福建医科大学第二临床医学院，2002年成为福建医学会风湿病学分会主任委员单位，2012年成为福建医学会变态反应学分会主任委员单位。医院病床编制2000张，设鲤城和东海两个院区，鲤城院区占地24.57亩，目前开放病床1172张；在建的东海院区占地142.6亩，规划床位1000张，2015年初一期门急诊医技楼、专科病房楼正式投入使用，开放床位300张，核心病房楼建设也已启动。此外还设非行政隶属分院石狮市医院和晋江市医院。目前医院在编人员1530人，合同制人员606人，高级职务人员309人，卫生部突出贡献中青年专家1人、国务院特殊津贴专家6人、全省百千万人才6人、全省卫生系统跨世纪学术和技术学科带头人19人、福建医科大学学科带头人10人，兼任国家、省、市专业学会主任委员10人，各专业学会副主任委员（副会长）44人、常务委员（常务理事）83人、委员（理事）181人，博硕士364人。