泉州市中医院编制病床370张，设置急诊科、内一科（心脑血管病、中风专科、消化内科）、内二科（呼吸、泌尿、内分泌及男性科）、外科骨伤科。痔疮科、肿瘤科、产科、五官科、口腔科、疯伤推拿（含蛇伤、烧伤科）、妇科、儿科、针灸科、皮肤美容科、中西结合科、家庭病床科等临床科室，13个医技辅助科室和30个专科专病门诊。泉州市中医院注重发挥中医特色，并不断引进现代医学新技术，促进中医现代化。内科系统建立CCU病房和血透室，外科系统建立ICU病房和现代化手术室，对各科急、危、重症进行著有成效的治疗和抢救，全面开展大、中型手术。