医院于1949年6月在福州成立，1956年11月与设在闽侯白沙汶溪的省第六康复医院合并，1960年在福州古屏路建立省皮肤病研究所。1980年更名为福建省皮肤病防治院。1987年迁回福州市，1990年医院更名为福建省皮肤病性病防治院。福建省皮肤病性病防治院是一所集医疗、科研、防治于一体的省级皮肤病专科医院，医院毗邻福州台江中亭街繁华商贸区，座落于江滨大道解放大桥（即万寿桥）右侧。院内设有皮肤科、皮肤外科、性病科、中西医结合皮肤科、特诊科等六个临床科室，编制床位100张，年门诊量17万人次以上。