福清市医院创办于1900年，由中华基督教美以美女布道会名义在福清龙田镇创办龙田妇孺医院,美国人明庶姑任院长,设15张病床。1921年2月医院迁入福清城关吴厝巷，设床位30张。1924年在现址筹建新院，1926年3月落成迁入。为纪念捐资的美国儿童会书记惠乐生女士，命名为福清私立惠乐生医院，设病床100张，分内、外、妇、儿四个科。1951年10月由闽候专署接办改为闽候专区医院。1956年6月闽侯专区撤销，医院划归福清县管辖，改称福清医院，设病床170张。1970年9月福清医院、防保站和血防站合并成立福清县人民防治院；1971年4月三家分立，名福清县医院。1990年福清建市后正式更名为福清市医院。