2011年4月,医院计划投资1.6亿，占地100亩、建筑面积61000平方米的新院区正式启用。该工程是坊子区重点建设项目，设计档次省内领先、国内一流。设床位650张，年出院2万余人次。新院使用后，医院打破原有的主布置，建立了8个中心，18个临床科室，6个医技特检科室。新医院在人才技术和设备数量上以高、精、尖、新为主，提供高端的服务和优惠的价格。老院区保留综合病房，为周边群众提供基本医疗服务。医院使用后，将更好的带动区域医疗技术的发展，发挥其在人才、技术、设备等方面的辐射作用，形成资源优势互补，人才技术共享的关系。与上级大型医疗机构建立技术协作关系，以进一步提高医疗技术水平，扩大治疗范围。计划争取在几年内将新院建设成为现代化、生态型、花园式，成为立足坊子、服务全市，省内一流的大型医疗集团。

医院现有诊疗中心8个，临床科室18个，医技、特检科室6个。其中，潍坊心脏病医院是与北京阜外心血管医院技术协作中心，由北京阜外医院心外科主任闫军主刀手术，是潍坊市重点专科。急症科为全区急救中心，神经内外科、肝胆外科、骨关节科、纤维脊柱科、肾脏外科、眼、耳鼻喉科、妇产科、普外科、呼吸内科、消化内科、肾脏内科、内分泌科、儿科、新生儿科为重点学科。近年来，医院坚持“科技兴院”方针，大力支持医疗人员开展新技术、新项目。在心脏外科手术、心脏介入治疗、恶性肿瘤标准化治疗、显微外科、腔镜微创手术等方面取得突破并形成技术优势，每年有10余项科研通过鉴定并获奖。心外科手术取得了多个“第一”。省内第一例年龄最小复杂先心，第一例体重最轻先心婴儿，市内第一例主动脉弓狭窄术，第一例全腔静脉肺动脉引流术，2010年，一名国外先心患儿慕名来医院进行先心手术治疗，康复回国。2012年10月，一例先心二次手术的患儿，在多方求救无果的情况下，由闫军教授亲自手术，痊愈出院。