西安交通大学第二附属医院于1937年在抗战烽火中为民族大义内迁而重建，医院源起1912年由国家教育部创办的中国第一所国立培养高级医学人才的医学院校;国立北京医学专门学校、国立北平大学医学院附属医院，也是中国第一所国立大学附属医院。1937年卢沟桥事变爆发，日本帝国主义发动全面侵华战争，在国家民族生死存亡之际，为反抗外敌入侵、保护和抢救中国教育文化精英和民族文化精髓，保卫中华文化之根基，国立北平大学、北平师范大学和北洋工学院奉教育部命令迁移西安，于1937年10月组建起了国立西安临时大学，北平大学医学院改为西安临时大学医学院，附属医院随迁重建。1938年3月再迁汉中，之后奉命更名为国立西北联合大学医学院附属医院。历经时代变迁和图强发展，医院名称多次变更，由最初的西北联大医学院、西北医学院附属医院更名为西安医学院第二附属医院、西安医科大学第二附属医院，直到今日之名西安交通大学医学院第二附属医院，西安交通大学第二临床医学院，第二院名又称西北医院。内迁七十多年来，为西北医学高等教育和现代医学科学的创立和发展做出了卓越的贡献。医院开放病床2200张，年收住各类病人7万余人次，年门急诊量150余万人次。拥有教职员工3600余名，其中有副高级以上专业技术职称专家400多名，享受国务院和陕西省特殊专家津贴的专家教授50多名；200名专家分别担任全国和省市级医学专业学会的主任委员、副主任委员或常委、委员等职务，100余名专家担任着全国相关学科专业杂志的主编、副主编或编委。医院现设有48个临床医技科室、专科病院和研究室，拥有数量众多的国家重点学科和国家临床重点专科，其中泌尿外科、皮肤病专业为国家教育部重点学科；骨外科、消化内科、临床专科护理、地方病科（地方性骨病、心肌病、碘相关及甲状腺疾病）、麻醉科、皮肤科、呼吸内科、耳鼻咽喉头颈外科、急诊医学科被国家卫计委评为国家临床重点专科建设单位。中医科被国家中医药管理局评为国家临床重点专科建设单位，并被卫生部、国家中医药管理局、总后卫生部评为全国综合医院中医药工作示范单位；骨外科、普通外科、呼吸内科、耳鼻咽喉科、血液内科被陕西省卫生厅评为陕西省医学重点学科；皮肤病院、消化内科、眼科、泌尿外科、麻醉科被陕西省卫生厅评为陕西省优势医疗专科；中医肾病学科被陕西省中医药管理局评为陕西省中医重点学科。此外，心血管内科、神经内科、肾病内科、内分泌科、神经外科、胸外科、心外科、妇产科、感染科、医学康复科、重症医学科和干部保健科等学科在相关领域的研究和诊治方面均形成了各自突出的优势和鲜明的特色，在西北及陕西省医学界中具有重要影响和学术地位，在广大百姓群众中也享有极高的认可度和良好的口碑。