重庆市巴南区中医院位于重庆南大门，巴南区龙洲湾街道。前身为重庆市巴县鱼洞镇卫生院，成立于1956年10月，1981年2月经四川省卫生厅批准改建成立巴县中医院；1990年经巴县人民政府批准由集体所有制单位转为全民所有制单位，1995年3月重庆市行政区划调整和巴县撤县建区，更名为重庆市巴南区中医院，1997年经重庆市中医管理局评审验收为国家二级中医院，2001年8月被重庆市卫生局批准为非营利性医疗机构，2012年6月，从鱼洞街道新市街11号搬迁至巴南区龙洲湾街道新院区。重庆市巴南区中医院是国家二级医院；国家爱婴医院；国际质量管理认证医院；重庆市交通事故快速抢救定点医院；重庆医科大学中医药学院和重庆市护士学校教学实习医院；巴南区城乡居民合作医疗保险定点医院、城镇职工医疗保险定点医院、工伤保险定点医院、生育保险定点医院、干部保健定点医院、商业保险定点医院；巴南区中医医、教、研基地。医院编制床位270张。第三军大学附属大坪医院（创伤医院）、重庆医科大学附属第一医院是我院技术指导医院。