济宁市妇女儿童医院的前身为济宁市专区妇幼保健所，始建于1955年，1964年更名为济宁地区妇幼保健站，1988年改称济宁市妇幼保健院，1994年3月与市妇幼医院合并，称市妇女儿童医院，1997年经市政府批准，加挂济宁市第三人民医院牌子。改革开放以来，该院先后设置妇产科、儿科、新生儿科、内科、急诊科、外科、中医科、耳鼻喉科、口腔科、痔瘘科、眼科、麻醉科等临床科室，药剂科、检验科、放射科、功能科、手术室、供应室等医技科室，妇保儿保、健康教育、预防保健等社保科室。医院开放床位200张，现有职工175人，其中专业技术人员145人（中级以上职称62人）。