医院设有急诊科、内科（含心血管、消化、呼吸、神经、内分泌、血液、肿瘤、中毒、肾内等专业）、外科（含泌尿外科、普通外科、烧伤整形外科、肛肠外科、颅脑外科、骨外科、手外科等专业）和五官科、儿科、妇科、产科等十多个临床专科及放射、影像、检验、病理等辅助诊断科室。另设有3间综合性门诊，其中2间设在清新县城的玄真路。